Girdeji:
- Öýjük sanamak, segmentasiýa we tutuş slaýd şekilinde (WSI) iş prosesinde AI-iň goldawyny düşündirmek ukyby;
- Reňklemegiň we skanirlemegiň üýtgemeginiň model öndürijiligine we domen çalşygyna täsirini tanamak ukyby
- Patologiýa AI netijelerini salgylanma standarty, nusga alma we patolog tassyklamasy bilen tassyklamak ukyby
Patologiýa, mikroskop astynda dokumanyň nusgasyny barlamak arkaly keseliň kesgitlenýän şahasydyr; Köp rak keseliniň "altyn standarty" bu ýerde edilýär. Sanly patologiýa, ýokary çözgütli skaner bilen aýna slaýdda reňkli dokuma bölümini sanlaşdyrmakdyr. Alnan faýla tutuş slaýd şekili diýilýär (gysgaça WSI); Singleekeje slaýd gigapiksel ululygynyň, ýagny milliardlarça pikseliň äpet şekili bolup biler. Emeli intellekt bu ullakan şekillerde öýjük sanamagy, sebit bölünişini we bahalandyrmagy goldaýar. Bu bölümde WSI-iň iş prosesini, iň uly tehniki çökgünligini göreris: boýag / skaneriň üýtgemegi we patologyň tassyklamagynyň näme üçin zerurdygyny.
Ilkibaşdan aýdalyň: emeli intellekt hasaplaýjy, deslapky skaner we patologiýada ikinji göz bolup biler; Canceröne rak keselini anyklamak, sahnalaşdyrmak we bahalandyrmak kararlary patologa degişlidir. Model diagnoz goýmaýar.
WSI iş akymynyň ädimleri
1-nji ädim - Ekran we hil gözegçiligi. Aýna slaýd skanirlenýär; Defokus, eplenýän bellikler we howa köpürjikleri ýaly kemçilikleri awtomatiki usulda tapyp bolýar. Qualityaramaz hilli skanerler asla modele girmeli däldir.
2-nji ädim - Kafel (patch) aýyrmak. Gigapixel şekili göni işlenip bilinmez; kiçi kwadratlara bölünýär (iňlisçe patch, adatça 256x256 ýa-da 512x512 piksel). Model her kafeliň aýratynlygyna baha berýär, soňra netijeler birleşdirilýär.
3-nji ädim - Dokma / öýjük derňewi. Model; Ösümlik ýerleriniň segmentasiýasy, mitoz (bölüji öýjük) sanamak, ýadro dykyzlygy ýa-da markeri hasaplamak (meselem, Ki-67 boýag derejesi) ýaly meseleleri ýerine ýetirýär. Çykyş san ölçegidir ýa-da ýylylyk kartasy.
4-nji ädim - Jebisleşdirmek we hasabat bermek. Kafeliň netijeleri slaýd derejesinde birleşdirilýär; Gysgaça mazmun, mysal üçin, "çiş meýdanynyň göterimi" ýa-da "mitotik san".
5-nji ädim - Patologlara baha bermek. Patolog, model bilen bellenen sebitleri we sanlary gözden geçirýär; kabul edýär, düzedýär ýa-da ret edýär. Diagnoz we baha bermek patologyň özüne bagly.
Iň uly çukur: Boýag we skaneriň üýtgemegi
Dokma bölümleri adatça H&E (gematoksilin we eozin; ýadro gök-gyrmyzy we sitoplazma gülgüne reňk berýän adaty boýag) bilen reňklenýär. Ainingöne boýagyň intensiwligi laboratoriýa, menek partiýasy, bölümiň galyňlygy we skaner markasy bilen ep-esli üýtgeýär. Adamyň gözi bu tapawutlara aňsatlyk bilen uýgunlaşýar; Model gabat gelmezligi mümkin.
Bir model A laboratoriýasynyň gülgüne-gyrmyzy reňklerine esaslanyp öwrenen bolsa, B laboratoriýasynyň has reňkli ýa-da garaňky reňkinde öndürijiligi peseler. Bu hadysa domen çalşygy diýilýär we sanly patologiýada şowsuzlygyň iň köp ýaýran sebäbi. Çözüw çemeleşmeleri: reňkleriň kadalaşmagy (şekilleri umumy reňk giňişligine geçirmek), köp merkezli okuw maglumatlary we iň esasysy - ulanyljak her bir laboratoriýada daşarky tassyklama.
Üç sany kiçi waka: Sanlar boýunça
1-nji hadysa - mitotik hasaplamada yzygiderlilik. Döş rak keselini bahalandyrmakda mitotik sanamak möhümdir, ýöne synçydan synça üýtgeýär. AI kömegi bilen bir laboratoriýada deslapky sanamak, iki patologyň arasyndaky ylalaşyk (kappa) 0,55-den 0.71-e çenli ýokarlandy we slaýdda sanamak wagty 4 minutdan 1,5 minuta çenli azaldy. Şeýle-de bolsa, her soňky sanany patolog tassyklady; Model teklip etdi, patolog karar berdi.
2-nji waka - Meýdanyň çalşygy. Çiş segmentasiýa modelini döreden laboratoriýada wagtyň 93% -i dogry işleýärdi. Şol bir model, başga bir skaner we boýag ulanyp, hyzmatdaş laboratoriýasynda çiş meýdanyna 20% baha berdi. Şol laboratoriýadan 200 slaýd bilen reňk kadalaşandan we täzeden tassyklanandan soň, tapawut kabul ederlikli derejä çenli azaldy.
3-nji hadysa - ýalňyşlyk. Bir model slaýdda "ýok" çiş diýdi; Şeýle-de bolsa, model diňe skanirlenen ýere baha berdi we çiş göçürilmedik bölümde boldy. Patologiýa diagnozy slaýd saýlamak we nusga almak ýaly gowy; AI "otrisatel" çykyş, aşaky nusganyň öwezini dolmaýar. Şonuň üçin diňe negatiw AI netijesi hiç haçan "kesel ýok" diýmegi aňlatmaýar.
Gowşak gyssagly / güýçli teklip
Bellik: Aşakdaky teklipler patologiýa hasabatyny we iş prosesiniň tekstini düzmek üçin; Dokum şekilini anyklamak, barlanan programma üpjünçiliginiň we patologlaryň işi.
Gowşak haýyş:
Bu patologiýa hasabatyna görä, düwnük barmy? [hasabat]
Güýçli haýyş:
Siziň roluňyz: Siz patologiýa hasabatynyň gurluş kömekçisi (SIZ DIAGNOSIZ däl). Aşakdaky näbelli patologiýa hasabatyny düzüň: - Nusga görnüşini, boýagy, çişiň görnüşi / derejesi, hirurgiki margin, markerleri düzüň. ýiten meýdanda “kesgitlenmedik” ýazyň.- Netijede, patologyň tassyklamaly 3 nokadyny sanaň. Anonim hasabat: [tekst]
Göçürip boljak dört şablon
1) Hasabatyň standartlaşdyrylmagy:
Aşakdaky näbelli patologiýa hasabatyny gurluşly meýdanlara ýerleşdiriň (organ, diagnoz, dereje, margin, marker göterimleri). Tekste ýapyşyň. Hasabat: [tekst]
2) Token yzygiderliligini barlamak:
Bu hasabatda agzalan ähli göterimleri we san belliklerini (Ki-67, ER, PR, HER2) sanaň; Biri-birine ýa-da diagnoz bilen gapma-garşy gelýän bahalary belläň. Hasabat: [tekst]
3) Model tassyklama meýilnamasy (sanly patologiýa):
WSI segmentasiýa modeli üçin tassyklama meýilnamasynyň taslamasyny ýazyň: reňkleriň kadalaşmagy, köp merkezli daşarky tassyklama, patolog şertnamasy (kappa), meýdan çalşygy synagy. Patology tassyklamak nokatlaryny aýratyn belläň.
4) Nusga alma duýduryşyny goşmak:
Aşakdaky negatiw AI netijesine goşuň, "seçip almak çäkli bolup biler, otrisatel netije keseli aradan aýyrmaýar" we patolog tassyklamagy talap edýär. Çykyş: [tekst]
Modeliň roly: Taslama görnüşi boýunça
Wezipe görnüşi
AI goşant
tankyt
barlamak
Çiş sebiti segmentasiýasy
beýik
beýik
Patolog + daşarky barlag
Mitoz / öýjükleriň sany
beýik
beýik
Patolog tassyklamasy
Markeriň göterimi (Ki-67)
beýik
orta
Salgy deňeşdirmesi
Hil gözegçiligi (fokus / kemçilik)
beýik
pes
ýerini barlamak
Hasabat konfigurasiýasy (tekst)
beýik
pes
Patolog tassyklamasy
Maslahat: Sanly patologiýada model teklibine baha berlende, hemişe soraň: "Bu model haýsy barlaghanalaryň tegmilleri we skanerleri öwredildi we laboratoriýamda tassyklandy?" Jogap "ýok" bolsa, öndürijilik sanlary entek size degişli däl.
Üns beriň: AI-iň "çiş ýok" diýmegi, alynmadyk dokumada çişiň ýokdugyny aňlatmaýar. Patologiýada ýaramaz netije, nusga almagyň hili bilen çäklenýär; nagyş bu çäkden geçip bilmez we negatiw netije anyklaýyş kepilligi däldir.
Adaty ýalňyşlyklar
- Reňk / boýagyň üýtgemegine pes baha bermek. Meýdanyň süýşmegi sanly patologiýada şowsuzlygyň iň köp ýaýran sebäbi.
- Bir merkezde tälim alyň we hemme ýerde ulanyň. Dürli brauzer we reňklemek sessiz öndürijiligiň peselmegini döredýär.
- Kepillik üçin negatiw netijäni ýalňyşdyrmak. Nusga almagyň çägini model bilen öwezini dolup bolmaz.
- Interobserweriň üýtgemegine ähmiýet bermezlik. Salgy standartynyň özi üýtgeýän bolsa, model şoňa görä baha berilmelidir.
- Patology ýok etmek. Hasaplamak we segmentasiýa goldawdyr; Diagnoz we derejeli patolog bilen dynç almak.
Gysgaça
- Sanly patologiýa gigapiksel WSI şekillerini plitkalara bölmek arkaly derňeýär; AI öýjük sanamak we segmentasiýa bilen goldaýar.
- Iň uly tehniki duzak, boýag / skaneriň üýtgemegi sebäpli meýdan süýşmesi; reňkleriň kadalaşmagy we daşarky tassyklamasy zerurdyr.
- Negativearamaz AI netijesi, nusga almagyň çäkleri bilen çäklendirilýär we anyklaýyş kepilligini bermeýär.
- Salgy standarty we interobserver üýtgeýşi modeli bahalandyrmagyň kontekstidir.
- Diagnoz, sahnalaşdyrmak we baha bermek patologyň jogapkärçiligidir; AI diagnoz goýmaýar.
Programma meselesi
Gipotetiki sanly patologiýa modelini saýlaň (meselem, Ki-67 göterim hasaplama). Bu model üçin daşarky tassyklama meýilnamasyny ýazyň: haýsy laboratoriýadan näçe slaýd, haýsy reňk kadalaşýar, patolog şertnamasyny nädip ölçärsiňiz we meýdan süýşmesini nädip synap görersiňiz. Soňra modeliň negatiw / polo positiveitel çykyşyna goşulmaly çäklendirme duýduryşyny bir sözlemde ýazyň.
gözegçilik sanawy
- [] WSI iş prosesiniň skanerini, plitkasyny, derňewini we kompozisiýa ädimlerini bilýärin.
- [] Boýagyň / skaneriň üýtgemeginiň meýdan süýşmegine sebäp bolýandygyna we dolandyrylyşyna düşünýärin.
- [] Negativearamaz AI netijesiniň nusga almagyň çäklidigine düşünýärin.
- [] Daşarky tassyklama we patolog şertnamasy (kappa) düşünjelerini ulanyp bilerin.
- [] Diagnoz we baha bermek kararynyň patologda galýandygyny düşündirdim.